Autoři Osek a Wieczorek z polského Národního veterinárního výzkumného ústavu v Puławy zkoumali přítomnost shiga toxin–produkujících Escherichia coli (STEC) na jatečně upravených tělech (JUT) skotu a prasat v letech 2019–2023 v Polsku. Celkem bylo testováno 368 JUT skotu a 87 JUT prasat za použití normy ISO/TS 13136 a izoláty STEC byly dále charakterizovány pomocí celogenomového sekvenování (WGS). Bylo zjištěno, že 119 (32,3 %) hovězích JUT a 14 (16,1 %) vepřových JUT bylo pozitivních na geny shiga toxinu stx.
Další analýza stx-pozitivních vzorků umožnila izolovat 32 (26,9 %) STEC hovězího původu a dva (14,3 %) STEC pocházející z vepřových JUT. Izoláty skotu byly klasifikovány do 21 různých sérotypů s nejrozšířenějším O168:H8 (3 izoláty), zatímco dva vepřové izoláty STEC patřily ke dvěma sérotypům (O8:H9 a O100:H30), které nebyly identifikovány u hovězích kmenů. Izoláty původem z JUT skotu byly pozitivní hlavně na gen shiga toxinu stx2, a to buď samostatně (61,5 %), nebo v kombinaci (38,5 %) s typem stx1 (celkem pozitivních 26 izolátů z 32, tj. 81,2 %). Dva STEC z JUT prasat byly pozitivní pouze na variantu stx2e. Všechny STEC, bez ohledu na původ, byly negativní na gen pro intimin eae. Na gen enterohemolyzinu ehxA bylo pozitivních 19 hovězích izolátů STEC.
V období 2014-2018 se v Polsku z 330 vzorkovaných hovězích JUT podařilo detekovat geny stx v 115 kusech (34,8 %) a ze 120 vepřových JUT bylo pozitivních 3 (30,8 %). Z pozitivních vzorků bylo získáno 37 hovězích a 5 vepřových izolátů STEC. Počet vzorků testovaných v obou studiích byl však odlišný, zejména u JUT prasat (87 a 120). Je třeba zmínit, že procenta pozitivních JUT ukazují pouze PCR-pozitivní vzorky (pravděpodobně STEC-pozitivní) a počet izolátů, tj. skutečný počet STEC-pozitivních vzorků byl nižší.
V letech 2023–2024 byla v regionu Emilia-Romagna (severní Itálie) naplánována studie k určení míry kontaminace kůží a JUT STEC u vyřazených dojnic během porážky. Bylo vzorkováno 60 zvířat, a to z povrchu kůže po vykrvení (z krajiny hrudí a pánevních končetin, celkem stěry z plochy 800 cm2) a z povrchu JUT po vykolení (plocha 400 cm2). Celkem bylo detekováno pět kmenů O177 STEC, a to čtyři ze tří JUT (5,0 %) a jeden ze vzorku kůže (1,7 %). Izoláty byly typizovány pomocí WGS následovně: 1) STEC O177:H11 sekvenční typ (ST) 765 (stx2a+, eae+), detekovaný z jednoho JUT; 2) STEC O177: H25 ST659 (stx2c+, eae+) detekované ze tří JUT a jednoho vzorku kůže. Jedno JUT bylo kontaminováno oběma sérotypy STEC. Izoláty nesly další determinanty virulence, které se často vyskytují v kmenech STEC spojených s hemolyticko-uremickým syndromem (HUS), jmenovitě geny exha, astA a espP spolu s geny pro adhezi k epiteliálním buňkám střeva (lpfA, fdeC, fimH). Izolát STEC O177:H11 obsahoval geny antimikrobiální rezistence (AMR) na β-laktamy (blaTEM-1A), aminoglykosidy (aadA1, aph(3″)-Ib, aph(6)-Id), trimethoprim (dfrA1), sulfonamidy (sul1, sul2), tetracykliny (tetA), (tetB), streptothricin (sat2) a kvartérní amoniové sloučeniny (qacEdelta1). Naopak izoláty STEC O177:H25 nenesly žádné geny AMR. Trvalé nosičství STEC O177:H25 ST659 (stx2c+, eae+) na úrovni farmy bylo potvrzeno testováním zvířat ze stejného stáda poslaných na porážku.
Je zajímavé, že kolonie STEC O177:H11 a STEC O177:H25 měly na miskách CHROMagar™ STEC odlišnou morfologii, byly fialové nebo bezbarvé. Vzhledem k tomu, že fialová je barva, kterou kolonie STEC běžně mají na médiu CHROMagar™ STEC, mohou naše zjištění pomoci mikrobiologům při výběru neobvyklých sérotypů. Podle našich nejlepších znalostí se jedná o první detekci STEC O177 z JUT a kůží dojnic na porážce. Je třeba poznamenat, že kůže pozitivní na STEC byla klasifikována jako „velmi špinavá“, což zdůrazňovalo potřebu čistých zvířat vstupujících do řetězce porážky, jak to vyžaduje nařízení (ES) č. 853/2004. Vzhledem k tomu, že bakterie STEC O177 jsou původci HUS v Evropě, data by mohla rozšířit informace o zdroji neobvyklých séroskupin v lidských infekcích.
Osek and Wieczorek: Isolation and molecular characterization of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) from bovine and porcine carcasses in Poland during 2019-2023 and comparison with strains from years 2014-2018. International Journal of Food Microbiology, 428; 2025; 110983.
Bonardi et al.: Emerging of Shiga toxin-producing Escherichia coli O177:H11 and O177:H25 from cattle at slaughter in Italy. International Journal of Food Microbiology, 423; 2024; 110846.
